L'origine del popolo rapanui è polinesiana? Sì, è oramai accertata la origine polinesiana (out of West, migrazione ovest-est) della prima colonizzazione dell'isola che la leggenda fa risalire al re Hotu Matu'a. Le ricerche che sostengono tale tesi si basano su: studi di antropologia fisica (o biologica) studi di genetica studi linguistici studi comparativi di antropologia culturale, architettura     George Gill. La forma e configurazione del cranio pasquense con il noto fenomeno della "mandibola a dondolo" (rocker jaw o rocking-chair jawbone) è presente nei 3/4 dei Polinesiani. La radice del naso è egualmente depressa nei Polinesiani e nei Pasquensi. Ma George Gill non escluse un contatto con il Sudamerica: Gill et Al. hanno ipotizzato più recentemente - pur non abbracciando la teoria out of East di Heyerdahl - che gruppi di polinesiani dalle Marchesi potrebbero essere giunti in Sudamerica, perdendo alcuni aspetti culturali propri (come il cane ed il maiale domestico) ed acquisendo nuovi dei, beni, abilità scultorie (e parole?); quindi tentarono di tornare indietro dalle coste sudamericane ma, incontrata la corrente di Humboldt, finirono sull'isola di Pasqua. [Gill ha anche scoperto l'80 % di "rotula fissurata" nei reperti ossei di Anakena: la malformazione ossea potrebbe attestare la endogamia spinta del clan dei Miru, che si ritenevano discendenti diretti di Hotu Matu'a e non si mescolavano con gli altri clan dell'isola. ] Nel 1993 Andrea Drusini dell'Università di Padova raccolse denti molari durante gli scavi dell'Ahu Tongariki sulla costa sudorientale dell'Isola di Pasqua. Questi denti risalgono a prima del 1722 e Drusini si accorse che parecchi molari inferiori erano dotati di 3 radici anziché di 2 come è il riscontro più frequente. Secondo uno studio mondiale di Turner e Benjamin del 1990 condotto su 11.318 individui tra cui 286 scheletri preistorici, il primo molare inferiore è dotato di tre radici con un frequenza maggiore nelle popolazioni asiatiche e in quelle da esse derivate, specialmente nelle popolazioni dell'Artico e dell'Asia settentrionale (25-30%), mentre fra gli Europei e gli Africani la frequenza si aggira intorno all'1%. Drusini ha voluto confrontare il dato dell'Ahu Tongariki con quello delle altre isole del Pacifico per verificare se esiste un andamento da ovest verso est di questo tratto anatomico e tentare di fornire una spiegazione dell'alta incidenza del primo molare inferiore triradicolato negli abitanti di Rapa Nui prima del contatto con gli Europei.Nei reperti di Tongariki il primo molare inferiore con tre radici raggiunge una frequenza del 28,5%, frequenza che supera di gran lunga quella della Polinesia, del Sudest Asiatico, del Nordamerica e del Sudamerica, che si aggirano tutte intorno al 10%. In crani dell'Isola di Pasqua studiati da Turner e Benjamin, la cui antichità è incerta, hanno fornito valori del 21,8%, per cui l'incidenza in reperti presumibilmente recenti è sempre elevata rispetto alla media polinesiana.Stando ai reperti di Tongariki risulta chiaro che gli abitanti di Rapa Nui avevano una delle più alte incidenze di primo molare inferiore triradicolato in seno alle popolazioni polinesiane e mondiali, in quanto la media mondiale come quella polinesiana è del 10%. Ma in Polinesia, se la media è intorno al 10%, troviamo arcipelaghi come Tuamotu, Samoa e Gambier dove la percentuale è pressoché zero. Drusini conclude che verosimilmente, come suggerito da Houghton, la scoperta dell'Isola di Pasqua da parte di Hotu Matua è stata un fatto accidentale con un poco credibile ritorno alla terra d'origine, per cui si sono verificate le condizioni ideali per il cosiddetto effetto del fondatore, del collo di bottiglia e della deriva genetica in seno ad una piccola popolazione priva di contatti che ha sviluppato un suo sistema genetico, il quale tende a persistere nel tempo. Il mosaico di distribuzione del primo molare inferiore triradicolato non solo nell'area polinesiana, ma in tutto il Pacifico, dovrebbe essere il risultato di molteplici effetti a collo di bottiglia (per l'accidentale riduzione di una popolazione) ai quali sono andati incontro i colonizzatori nell'andirivieni attraverso il Pacifico. Le stesse considerazioni si possono fare, secondo Drusini, anche a proposito del mosaico nella distribuzione attraverso il Pacifico della mutazione 9-bp caratteristica dell'aplogruppo B dell'mtDNA. Secondo Drusini "in realtà, stando alla letteratura più recente, la grande maggioranza degli studiosi del Pacifico non propende per una trascorsa presenza amerindiana nell'Isola di Pasqua. Le analogie riscontrate da Thor Heyerdahl riguardano il tipo di costruzioni architettoniche, ma i dati biologici come lo studio del DNA mitocondriale effettuato su ossa di antichi abitanti di Pasqua dalla Dott.ssa Erika Hagelberg di Cambridge, propendono per l'affinità con le popolazioni dell'area polinesiana e del Sudest asiatico, dove c'è una maggior frequenza della variazione 9bp. Secondo gli archeologi nell'Isola di Pasqua: 1) non vi sono prove di due migrazioni successive e tantomeno di origine americana, anche se non si possono escludere con certezza 2) non vi sono caratteristiche antropologiche che attestino affinità con le popolazioni amerindiane (bisogna ricordare che sia i Polinesiani che gli Amerindi sono di ceppo asiatico, ma i secondi hanno un'origine più antica e questo per i genetisti si traduce in una maggiore variabilità dal punto di vista genetico; inoltre, nelle popolazioni degli isolati geografici si riconoscono effetti "a collo di bottiglia" o "del fondatore", come ad esempio la maggiore frequenza della variazione 9bp nel mtDNA, oppure, fenotipicamente, del primo molare mandibolare con tre radici, che si riscontra nell'8% dei casi nelle popolazioni polinesiane e nel 29% dei casi nella popolazione dell'Isola di Pasqua)." Prima non disponevamo di evidenze genetiche precise. Oggi, grazie allo studio mirato del DNA mitocondriale (mt-DNA) e DNA legato al cromosoma Y, siamo in grado di analizzare queste parti del codice genetico che risultano sufficientemente "invarianti": l'mt-DNA, di derivazione materna, rimane infatti immutato da una generazione all'altra e quindi si presta attraverso la analisi di mutazioni prevedibili lungo una sequenza spazio-temporale, e consente di ricostruire un cammino a ritroso lungo l'albero genealogico e le linee di diffusione-migrazione dell'Homo Sapiens. Parimenti il DNA legato al cromosoma Y, di derivazione maschile, consente di mappare l'albero genealogico e la linea di diffusione-migrazione del soggetto maschio di Homo Sapiens. Le mappature di mt-DNA e di Y-DNA sono sufficientemente coincidenti ed hanno per esempio permesso di avvalorare la tesi paleoantropologica di una unica migrazione di Homo Sapiens "out of Africa" 60.000-70.000 anni fa. Erika Hagelberg - in Genetic Polymorphisms in Prehistoric Pacific Islanders, Nature, 5 maggio 1994 - circa la possibilità di una colonizzazione dell'Isola di Pasqua a partenza dal Sudamerica, afferma che studi sulla regione ipervariabile dell'mtDNA in nativi americani hanno mostrato una molto maggiore eterogeneità dell'mtDNA in America rispetto alla Polinesia, indice di ondate migratorie multiple, e che negli Amerindi non si sono riscontrate le caratteristiche dell'mtDNA osservate sull'Isola di Pasqua. La delezione 9-bp è presente attraverso le Americhe, l'Asia e il Pacifico, spesso associata ad una sostituzione nucleotidica alla posizione 16.217: ciò depone semplicemente per un'origine ancestrale comune ad Oceania e Nuovo Mondo. Ma ciò che gli Amerindi non presentano sono due altre sostituzioni nella molecola di mtDNA: le sostituzioni alle posizioni 16.247 e 16.261, presenti invece nei Polinesiani e riscontrate a Rapa Nui in mtDNA antico di reperti scheletrici dell'Ahu Tepei (1000-1680) e dell'Ahu Vinapu (1680-1868), come riferisce Drusini. Pertanto, l'assenza nel Nuovo Mondo di queste due sostituzioni che potremmo definire prettamente polinesiane, deporrebbe per la mancanza di contatti significativi fra Polinesia ed Americhe. In Polinesia esiste una tradizione orale secondo la quale Polinesiani e Amerindi entrarono fra loro in contatto in epoca precolombiana. Rebecca Cann (in Hawaii Magazine, febbraio 1997, citata da Sione Ake Mokofisi) afferma che, in base all'analisi dell'mtDNA, alcuni Amerindi del nord e del sud presentano legami coi Polinesiani di Samoa: in Nordamerica i Nuu-chal-nulth di Vancouver, in Sudamerica i Cayapa, i Mapuche, gli Huilliche e gli Atacamenos. Secondo Houghton (1996, citato da Drusini) sembra che la scoperta dell'Isola di Pasqua sia stata un evento accidentale e che viaggi di ritorno da Rapa Nui siano un fatto piuttosto inverosimile. Ma Cann si spinge oltre e si contrappone all'affermazione di Houghton, chiedendosi se effettivamente i Polinesiani, dopo aver raggiunto Rapa Nui, abbiano deciso di porre fine alle loro peregrinazioni senza spingersi oltre. Quest'ipotesi di Cann è in netto contrasto con quella che va per la maggiore e che con ostinazione nega ai Polinesiani qualsiasi possibilità di aver raggiunto l'America oppure per gli Amerindi di aver toccato la Polinesia. Sebastian Englert ammetteva un secondo flusso immigratorio (da Est?) dei Tangata Hanau Eepe (= uomini di razza corpulenta, tradotti malamente con "Orecchie lunghe", i quali sarebbero giunti dall'Est senza donne e risultarono "dominanti" (pag. 89 di La tierra de Hotu Matu'a, Historia y etnologia de la isla de Pascua, (1974, Editorial Universitaria, Santiago del Chile): si contrapposero ai Tangata Hanau Momoko (= uomini di razza magra, detti "Orecchie corte") i quali sarebbero arrivati da Ovest con il leggendario re Hotu Matu'a (1300-1500 d.C.).